1、保證菌種的純培養，注意不要用被雜菌污染的菌種，不要近距離相連接培養。

　　2、嚴格控制菌種傳代次數，減少機械損傷，保證菌種活力。

　　3、適當低溫保存菌種，低溫型菌種如蘑菇、香菇等，在4℃有利于保存菌絲體的活力，高溫型菌種如草菇在16℃有利于保存菌絲體的活力。

　　4、避免在單一培養基中多次傳代;菌種不宜過(guò)長(cháng)時(shí)間使用，超齡菌種會(huì )出現老化，而老化與退化是有機相連的，生活力弱的菌種很容易出現退化。

　　5、菌種要定期進(jìn)行復壯，在適溫、合適酸堿度、充足氧量、無(wú)雜菌培養等條件下進(jìn)行。

　　6、每年進(jìn)行孢子分離，以有性繁殖來(lái)發(fā)現優(yōu)良菌株，以組織分離來(lái)鞏固優(yōu)良菌株的遺傳特性。